上海海事大學信息工程學院由計算機科學系、電子工程系、基礎信息教育系、實驗中心、船舶信息工程研究所和船舶信息技術研究所組成。目前有5個本科項目、2個信息管理與信息系統專業(yè)碩士項目、3個一級專業(yè)碩士項目、7個學術碩士項目和3個專業(yè)碩士項目。目前,學院已建成水聲傳感器網絡實驗室、智能海事網絡實驗室、水下信息處理實驗室和機器視覺實驗室。上海海事大學信息工程學院現有教職工119人,其中專職教師89人,博士生62人。有1700多名本科生和210名研究生。
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